［主な変更点］
１．Publication Types
Publication Typesを階層構造にするため、初めて、Tree Numbersが割り当てられた。
以下の新しいPublication Typesも追加された：
Publication Components [Publication Type];
Publication Formats [Publication Type];
Study Characteristics [Publication Type].
昨年中に、Research Support, N.I.H., Extramural and Research Support,
N.I.H., Intramuralの代わりに、Support of Researchが追加された。
3つのPublication Typesが2006年のMeSHでは削除された。これはレビュー文献に関する用語の合理化である。
2006年MeSH
Review [Publication Type]
2005年MeSH
Review [Publication Type]
Review of Reported Cases [Publication Type]
Review, Multicase [Publication Type]
Review, Tutorial [Publication Type]
3つの削除されたPublication TypesはReview [Publication Type]エントリーターム（See参照）に追加され、これらが索引付けされている文献はより一般的用語に修正される。
※２００６年現在、PubMedで用いられるPublication Typeのリストは章末を参照。
２．Organisms
Mollusca（軟体動物門）の見出し語が、修正の上、拡張された。
Primates（霊長類）の見出しが、修正された。
Whales（鯨）とDolphins（イルカ）とPorpoises（ネズミイルカ）の特殊な種・属の多くのエントリータームが、MeSH用語として昇格した。
サブカテゴリとしてMesomycetozoea（B8）が新設された。 これは、祖先が動物－菌類分岐の近くでまで遡る、寄生性で雑菌性の微生物の綱である。
３．Drugs and Chemicals
Ｄのサブカテゴリの再編成は継続している。 比較のために、以下に2006年と2005年の構成を示す。 Ｄ７、Ｄ１１、Ｄ１４～Ｄ１９、Ｄ２１、Ｄ２２、Ｄ２４がなくなり、Ｄ２３がDermatologic
AgentsからBiological Factorsに変わったのがわかる。
2006年MeSH
Inorganic Chemicals [D01]
Organic Chemicals [D02]
Heterocyclic Compounds [D03]
Polycyclic Compounds [D04]
Macromolecular Substances [D05]
Hormones, Hormone Substitutes, and Hormone Antagonists [D06]
Enzymes and Coenzymes [D08]
Carbohydrates [D09]
Lipids [D10]
Amino Acids, Peptides, and Proteins [D12]
Nucleic Acids, Nucleotides, and Nucleosides [D13]
Complex Mixtures [D20]
Biological Factors [D23]
Biomedical and Dental Materials [D25]
Pharmaceutical Preparations [D26]
Chemical Actions and Uses [D27]
2005年MeSH
Inorganic Chemicals [D01]
Organic Chemicals [D02]
Heterocyclic Compounds [D03]
Polycyclic Compounds [D04]
Macromolecular Substances [D05]
Hormones, Hormone Substitutes, and Hormone Antagonists [D06]
Reproductive Control Agents [D07]
Enzymes and Coenzymes [D08]
Carbohydrates [D09]
Lipids [D10]
Growth Substances, Pigments, and Vitamins [D11]
Amino Acids, Peptides, and Proteins [D12]
Nucleic Acids, Nucleotides, and Nucleosides [D13]
Neurotransmitters and Neurotransmitter Agents [D14]
Central Nervous System Agents [D15]
Peripheral Nervous System Agents [D16]
Anti-Inflammatory Agents, Antirheumatic Agents, and Inflammation Mediators
[D17]
Cardiovascular Agents [D18]
Hematologic, Gastrointestinal, and Renal Agents [D19]
Complex Mixtures [D20]
Anti-Allergic and Respiratory System Agents [D21]
Antineoplastic and Immunosuppressive Agents [D22]
Dermatologic Agents [D23]
Immunologic and Biological Factors [D24]
Biomedical and Dental Materials [D25]
Pharmaceutical Preparations [D26]
Chemical Actions and Uses [D27]
作用の結合と構の意味付けによるMeSH用語の再構成のための長年の努力は、2006年のMeSHでも続けられている。 D27に残っているそれらの用語は、Pharmacologic
Actions（PA）として使われる作用の用語である。 これらの構造的な用語は、Dカテゴリーの適当な配置のためにチェックされて、適当な作用の位置にPAを新設した。
４．Biological Fusion（生物学的融合）
MeSHの異なる「fusion（融合）」の概念を更新するために、遺伝子融合と膜融合に関する変更が行われた。
2006年には、約20のMeSH用語が新設された。 それらは、Artificial Gene Fusion,
Oncogene Fusion, Mutant Chimeric Proteins, and Membrane Fusion Proteinsなどである。 Membrane
Fusion Proteins（膜融合タンパク質）の主要な種類が新設され、最も頻繁に引用されるものはSCRから昇格し、Membrane
Proteins（膜たんぱく質）の下位概念に置かれた。 そして、その下位概念（結合、分解）と見出し語マッピングは、適当な新しいMembrane
Fusion ProteinsやMutants Chimeric Proteins、古いRecombinant Fusion Proteinsにマッピングする170以上のSCRに更新された。
５．Non-Placental Animal Reproduction（非胎盤動物生殖）
非胎盤動物の生殖に関する新しい概念が新設された。 それらは以下のようなものである：
Clutch Size（クラッチ・サイズ）
Oviparity（卵生）
Ovoviviparity（卵胎生）
Viviparity, Nonmammalian（非哺乳類胎生）
Pregnancy（妊娠）は胎盤生物だけで用いられる。 Clutch Size（クラッチ・サイズ）は卵生か卵胎生動物だけで用いられる。 Litter
Size（リター・サイズ）は胎生動物に用いられる。
６．Vitamins Category Change
MeSHは、以前、個々の栄養素をビタミンの下位概念に移動した。 これらの一部は他のものに化学的に使われるように、今回、ビタミンはD27（化学的作用・利用）で作用のMeSHとして見られるようになった。 個々のビタミン剤はSugar
Acidsの下位概念のAscorbic Acidのような化学製品としてそれらの適当な場所に移動し、各々はビタミンのPharmacologic
Action（PA）を有している。 このため、PubMedで「ビタミン」を検索するときは、PAの自動エクスプロードによって、個々のビタミンに関する文献の検索がサポートされる。
カテゴリー別 ２００６年新語数
A2 (Musculoskeletal System) １９語
A3 (Digestive System) ３語
A5 (Urogenital System) ４語
A6 (Endocrine System) ３語
A8 (Nervous System) １語
A9 (Sense Organs) ３語
A10 (Tissues) ９語
A11 (Cells) ９語
A15 (Hemic and Immune Systems) １語
B1 (Animals) ５５語
B3 (Bacteria) １０語
B4 (Viruses) １４語
B5 (Fungi) ５語
B6 (Plants) ８語
B8 (Mesomycetozoea) １語
C3 (Parasitic Diseases) １語
C4 (Neoplasms) ６語
C5 (Musculoskeletal Diseases) ５語
C6 (Digestive System Diseases) ２語
C7 (Stomatognathic Diseases) １語
C9 (Otorhinolaryngologic Diseases) １語
C10 (Nervous System Diseases) １２語
C11 (Eye Diseases) ２語
C12 (Urologic and Male Genital Diseases) ７語
C13 (Female Genital Diseases and Pregnancy Complications) ７語
C14 (Cardiovascular Diseases) ５語
C15 () ２語
C16 (Congenital, Hereditary, and Neonatal Diseases and Abnormalities) １０語
C18 (Nutritional and Metabolic Diseases) ５語
C19 (Endocrine System Diseases) １０語
C20 (Immune System Diseases) １語
C21 (Disorders of Environmental Origin) ４語
C22 (Animal Diseases) １語
C23 (Pathological Conditions, Signs and Symptoms) ７語
D1 (Inorganic Chemicals) １語
D2 (Organic Chemicals) １３語
D3 (Heterocyclic Compounds) ９語
D4 (Polycyclic Compounds) １語
D5 (Macromolecular Substances) ２２語
D6 (Hormones, Hormone Substitutes, and Hormone Antagonists) ６語
D8 (Enzymes and Coenzymes) １８２語
D9 (Carbohydrates) ４語
D10 (Lipids) １語
D12 (Amino Acids, Peptides, and Proteins) ５２６語
D13 (Nucleic Acids, Nucleotides, and Nucleosides) １語
D23 (Biological Factors) ４３語
D27 (Chemical Actions and Uses) １３語
E1 (Diagnosis) ７語
E2 (Therapeutics) ４語
E3 (Anesthesia and Analgesia) １語
E4 (Surgical Procedures, Operative) ７語
E5 (Investigative Techniques) ４語
E6 (Dentistry) ２語
F3 (Mental Disorders) ２語
G3 (Environment and Public Health) ２語
G4 (Biological Phenomena, Cell Phenomena, and Immunity) ４語
G5 (Genetic Processes) ４語
G6 (Biochemical Phenomena, Metabolism, and Nutrition) １０語
G7 (Physiological Processes) ２語
G8 (Reproductive and Urinary Physiology) ７語
G11 (Musculoskeletal, Neural, and Ocular Physiology) １語
G12 (Chemical and Pharmacologic Phenomena) ２語
G13 (Genetic Phenomena) ４語
G14 (Genetic Structures) １１語
H1 (Natural Sciences) １語
I1 (Social Sciences) １語
I3 (Human Activities) １語
J1 (Technology, Industry, and Agriculture) ３語
L1 (Information Science) ４語
N1 (Population Characteristics) １語
N4 (Health Services Administration) １語
V1 (Publication Components [Publication Type]) １語
V2 (Publication Formats [Publication Type]) １語
V3 (Study Characteristics [Publication Type]) １語
V4 (Support of Research) ３語
合計 のべ１，１４８語
※PubMedで用いられるPublication Typeの全リスト（階層構造版）
Addresses
Lectures
Bibliography
Case Reports
Clinical Conference [for reports of clinical case conferences only]
Clinical Trial [includes all types and phases of clinical trials]
Clinical Trial, Phase I
Clinical Trial, Phase II
Clinical Trial, Phase III
Clinical Trial, Phase IV
Controlled Clinical Trial
Multicenter Study
Randomized Controlled Trial
Comment [for comment on previously published article]
Congresses
Overall [collection of articles; consider Meeting Report]
Corrected and Republished Article [consider Published Erratum]
Dictionary
Directory
Duplicate Publication [duplication of material published elsewhere]
Editorial
Evaluation Studies
Government Publications
Guideline [for administrative, procedural guidelines in general]
Practice Guideline [for specific health care guidelines]
Historical Article [for articles about past events]
Biography
Interview
Classical Article [for republished seminal articles]
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Journal Article [excludes Letter, Editorial, News, etc.]
Review
Legal Cases [includes law review, legal case study]
Legislation
Letter [includes letters to editor]
Meta-Analysis [quantitative summary combining results of independent
studies]
News [for medical or scientific news]
Newspaper Article
Patient Education Handout
Periodical Index [for cumulated indexes to journals]
Published Erratum [consider Corrected and Republished Article]
Retraction of Publication [author's statement of retraction]
Retracted Publication [article later retracted by author]
Review
Consensus Development Conference
Consensus Development Conference, NIH
Scientific Integrity Review [U.S. Office of Scientific Integrity reports]
Technical Report
Twin Study [for studies of twins]
Validation Studies
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ＭｅＳＨ２００６年版の変更
ＭｅＳＨ２００６年版の改訂のポイント
